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封印的卡片是《魔卡少女樱》又名《百变小樱》或《库洛魔法使》《CardCaptor Sakura》的第2部剧场版，第1部没有名字，大家公认为《香港之旅》。《封印的卡片》紧接在TV版70集后，是整个故事的大结局（不过后面还有一部同时上映的剧场版3，但与整个故事无关）

柯南在街头目睹一名正打电话的警察在雨中被射杀，忙将凶手追踪，但凶手逃脱。死者闭眼一刻紧抓左胸，似乎有所暗示。事后柯南从目暮警官口中了解到紧抓左胸是暗示那里有警察手册。不久又有警察手拿警察手册被人射杀于地下车库。对于这两起案件，目暮警官等人一反常态不愿向毛利小五郎及柯南透露太多信息。毛利不甘心进一步追问，白鸟警官只答一句“Need not to know”。该话是警察之间所用的密语，意味这两起杀人事件与警察内部人士有关。

上流社会名媛桃丽目睹丈夫被孪生杀手刺杀，警方派尹和猫仔保护目击证人。某夜桃丽要去参加好友的生日派对，在派对上孪生杀手对其动手，幸好有尹及时相救，桃丽感激尹的救命之恩，送了一条名贵领带给尹，两人开始慢慢熟悉了解对方。与此同时，尹因与太太霭明相聚时间少发生多次争吵。尹迷惘中情陷桃丽，清晨，孪生杀手潜入大厦，一阵枪战过后，其中一名杀手被击毙。另一杀手为了报酬，挟持了尹的孩子……

布鲁诺•巴塔利亚和自己的妈妈生活在一起。他的妈妈超级肥胖，而且喜欢穿自己设计和制作的很夸张的衣服，他的爸爸是一名警察，但早已经和他们母子疏远了。在参加学校举行的拼字比赛中，布鲁诺决定穿裙子来表现自己，但是他却因此引来了众多非议和批评，也包括他的爸爸。后来在奶奶的帮助下，布鲁诺才赢得了爸爸的理解，不仅赢得了拼字大赛，而且也有机会实现爸爸少年时没有实现的梦想。

高中学生艾利克斯-伯朗宁正与法语课的同学们登上一架飞往巴黎的飞机。所有的乘客都已登机并扣好安全带，飞机即将起飞。突然，艾利克斯有了一种强烈的不祥预感，他仿佛看见这架飞机起飞不久便在空中爆炸，变成一团火球。惊恐万状的艾利克斯大吵大闹，让所有人都离开飞机，由此引发了机舱内的一场混战。最后，包括艾利克斯在内的7名乘客被赶出了机舱。 回到机场后的艾利克斯被其他6名乘客团团围住，其中包括他的朋友...