从一个灵气枯竭的末法时代，来到了武道昌盛的世界，诡异死亡的灵种，危机四伏的局面，让处于深渊的王昊何去何从？

夏目偶然与同学结城重逢，回忆起了被妖怪缠身的记忆。此时，夏目认识了津村容莉枝。和玲子相识的她，现在和独子一同过着平稳的生活。但这对母子居住的城镇，却似乎潜伏着妖怪。寄生于猫咪老师身体的“妖之种”，在藤原家的庭院中，一夜之间就长成树结出果实。而吃掉了果实的猫咪老师，竟然分裂成了3个……

神秘的生物渊种突然出现，将地球变成了它们的游乐场。为了拯救地球，人类必须团结起来，击败所有的渊种。n然而，人类并非毫无希望。在这个关键时刻，一批生猛的力量出现了。他们是人类中的勇士，拥有强大的能力和智慧，能够对抗渊种，保卫地球。n在这场战斗中，人类将面临无数的挑战和困难。他们需要团结一致，发挥各自的特长，才能击败渊种。同时，他们也需要探索渊种的弱点，寻找战胜它们的方法。n这个故事充满了悬念和紧张气氛，让人期待接下来的发展。人类是否能够成功击败渊种，保卫地球？那些生猛的力量究竟来自何处，他们又有什么特殊的能

斗魂圣地一战之后，为了拯救枯萎的灵界灵树，六支浇灌灵树灵液化作灵树之种，由紫染苍麟带回灵界的灵树圣地栽种。 谁知两人在圣地却遭到月族长老镜影花的袭击，镜影花欲吸收灵树之种的力量完成自己的野心，在苍麟拼死牵制下，紫染带着灵树之种开始逃亡，在被追杀途中意外碰到了从地界过来灵界的斗魂卫张山峰一行人。 得知镜影花要吸收灵树之种然后反攻地界的野心，斗魂卫一行人决定要保护紫染回灵树圣地种下种子。

经历过圣石之种事件半年后的高町奈叶与菲特·泰斯特罗莎两人则以朋友方式重逢，但随后卷入了一场袭击奈叶的大战。敌人目的正是以非法手段夺取魔导师的魔力资质，从而引发了时空管理局的重视和调查。