大学的新学期伊始。 心无杂念头脑里只想着如何改良自己做的无人机KAKA的单单，在热闹非凡的各大社团招新人海中略显得有些格格不入。 在单单从校舍后方的广场向延绵海岸扔出飞碟进行无人机KAKA的捕捉测试时，因为海风的影响飞碟不小心飞到了一名女生的身上。 这突如其来的事故，却变为了使原本有些自闭的单单逐渐成长的契机。

《超级赛罗格斗》是圆谷公司特摄的一部后续作品，主要是讲述《奥特曼传奇》电影后的故事，其目的就是为了给赛罗奥特曼一个新型创造的空间！

从行星波利斯逃脱等待重返地球的空间盘龙号，自称“雷奥尼克斯猎人”的神秘男子侵入其中。同时，其他的宇宙人们也正暗中开始行动，ZAP SPACY的船员们被卷入战争。

故事的主人公是喜欢魔法的高中生黒羽快斗，他的父亲是在8年前因事故而死亡的大魔法师·黒羽盗一。某日，他在房间一栋隐秘门中发现传说中的怪盗基德的衣服，于是他打算会见基德。在那里，他遇到了父亲过去的同伴·寺井，并得知父亲就是怪盗基德，而且死因不是事故死而是他杀。于是，快斗为查出杀害父亲的犯人，而自己成为了基德。本作和《名侦探柯南》有不少共通点。例如怪盗基德在两作中均有出现、迷之组织的登场、主人公真正身份不被世人所知，等等，感觉就像是融合了魔法元素的柯南。